Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSH3Q8TE77 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SSH3Q8TE77 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH3Q8TE77 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH3Q8TE77 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH3Q8TE77 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH3Q8TE77 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH3Q8TE77 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms