Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPC24Q8NBT2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms