Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMCO5AQ8N6Q1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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TMCO5AQ8N6Q1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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