Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms