Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SKAP1Q86WV1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms