Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms