Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM15Q7Z3B0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms