Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SSX7Q7RTT5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX7Q7RTT5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms