Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMUB2Q71RG4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms