Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PREX2Q70Z35 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PREX2Q70Z35 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PREX2Q70Z35 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PREX2Q70Z35 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PREX2Q70Z35 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PREX2Q70Z35 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PREX2Q70Z35 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PREX2Q70Z35 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PREX2Q70Z35 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PREX2Q70Z35 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PREX2Q70Z35 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PREX2Q70Z35 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms