Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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