Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms