Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRNIPQ6NTE8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MRNIPQ6NTE8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms