Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms