Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
VIRMAQ69YN4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
VIRMAQ69YN4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VIRMAQ69YN4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VIRMAQ69YN4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms