Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF123Q5XPI4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF123Q5XPI4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms