Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms