Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC39BQ5VTQ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms