Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN9Q5TKA1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN9Q5TKA1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms