Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms