Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EIPR1Q53HC9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIPR1Q53HC9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIPR1Q53HC9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIPR1Q53HC9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIPR1Q53HC9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIPR1Q53HC9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIPR1Q53HC9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIPR1Q53HC9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIPR1Q53HC9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIPR1Q53HC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms