Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms