Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms