Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms