Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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