Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA2Q15822 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA2Q15822 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms