Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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