Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNIP1Q15025 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms