Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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