Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LSAMPQ13449 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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