Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2V1Q13404 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2V1Q13404 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms