Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPAQ13219 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPPAQ13219 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
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