Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 PEX10YDR265W 1014 nt2.98□□□□□ -1.93
USB1Q12208 WBP1YEL002C 1293 nt2.98□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YLR402WYLR402W 192 nt2.98□□□□□ -1.93
USB1Q12208 FDH1YOR388C 1131 nt2.98□□□□□ -1.93
USB1Q12208 AUS1YOR011W 4185 nt2.98□□□□□ -1.93
USB1Q12208 JEN1YKL217W 1851 nt2.97□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YDR149CYDR149C 708 nt2.97□□□□□ -1.93
USB1Q12208 SPT4YGR063C 309 nt2.97□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YGR273CYGR273C 525 nt2.97□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YJL028WYJL028W 336 nt2.97□□□□□ -1.93
USB1Q12208 SHH3YMR118C 591 nt2.97□□□□□ -1.93
USB1Q12208 NDJ1YOL104C 1059 nt2.97□□□□□ -1.93
USB1Q12208 VPS21YOR089C 633 nt2.97□□□□□ -1.93
USB1Q12208 CNS1YBR155W 1158 nt2.97□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YHR202WYHR202W 1809 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 QRI7YDL104C 1224 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 FAP7YDL166C 594 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 RPB7YDR404C 516 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MTM1YGR257C 1101 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YIR040CYIR040C 333 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 SOD1YJR104C 465 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MTR2YKL186C 555 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 ECM4YKR076W 1113 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 SIL1YOL031C 1266 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MNT4YNR059W 1743 nt2.96□□□□□ -1.94
USB1Q12208 STP1YDR463W 1560 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 FRE4YNR060W 2160 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 DSL1YNL258C 2265 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YOL019WYOL019W 1656 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 PHO5YBR093C 1404 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MIG1YGL035C 1515 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 CCM1YGR150C 2595 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 TFC1YBR123C 1950 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 PSF1YDR013W 627 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 SDS3YIL084C 984 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 ENT3YJR125C 1227 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YIM2YMR151W 438 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 SSE2YBR169C 2082 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 HER2YMR293C 1395 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 SEC15YGL233W 2733 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 RIF1YBR275C 5751 nt2.95□□□□□ -1.94
USB1Q12208 ACK1YDL203C 1872 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 SSM4YIL030C 3960 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 HIM1YDR317W 1245 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 LIF1YGL090W 1266 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YKL071WYKL071W 771 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YMR141CYMR141C 309 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 RRG9YNL213C 645 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MCK1YNL307C 1128 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 SAS5YOR213C 747 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YPL168WYPL168W 1293 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 SUI3YPL237W 858 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 OPY1YBR129C 987 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 SHE3YBR130C 1278 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 PUS9YDL036C 1389 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 TRE2YOR256C 2430 nt2.94□□□□□ -1.94
USB1Q12208 THR4YCR053W 1545 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 GCN1YGL195W 8019 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 RPS14AYCR031C 414 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YDL242WYDL242W 354 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 PDS1YDR113C 1122 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 FRQ1YDR373W 573 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YHL026CYHL026C 948 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YVH1YIR026C 1095 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 AIM26YKL037W 357 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MBR1YKL093W 1020 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 CPR8YNR028W 927 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 PEX11YOL147C 711 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 DIB1YPR082C 432 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 PMS1YNL082W 2622 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 NUP60YAR002W 1620 nt2.93□□□□□ -1.94
USB1Q12208 ENA2YDR039C 3276 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 ENA1YDR040C 3276 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 ARG5,6YER069W 2592 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MPC54YOR177C 1395 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 RPC11YDR045C 333 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 FCF1YDR339C 570 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YKL177WYKL177W 339 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YMR084WYMR084W 789 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 RPL13BYMR142C 600 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 IMP1YMR150C 573 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 DGA1YOR245C 1257 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 FES1YBR101C 873 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 DSN1YIR010W 1731 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YLR352WYLR352W 2424 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 GIS4YML006C 2325 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 LCB4YOR171C 1875 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 ERG9YHR190W 1335 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 RTT109YLL002W 1311 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 SRO9YCL037C 1305 nt2.92□□□□□ -1.94
USB1Q12208 TDA3YHR009C 1572 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MSR1YHR091C 1932 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 NFI1YOR156C 2181 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 RPA135YPR010C 3612 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YIG1YPL201C 1386 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 YHR080CYHR080C 4038 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MTC3YGL226W 372 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 ARC15YIL062C 465 nt2.91□□□□□ -1.94
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