Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PUDPQ08623 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms