Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms