Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms