Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN1BQ07699 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms