Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	SOD1	YJR104C	465 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YNL162W-A	YNL162W-A	219 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	IDH2	YOR136W	1110 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	PLP2	YOR281C	861 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	DER1	YBR201W	636 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	MNL1	YHR204W	2391 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YVC1	YOR087W	2028 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	MSD1	YPL104W	1977 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	SWH1	YAR042W	3567 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YCF1	YDR135C	4548 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	OPI6	YDL096C	327 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	ATP5	YDR298C	639 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	IMP3	YHR148W	552 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	AGE2	YIL044C	897 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	NOC2	YOR206W	2133 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	STP22	YCL008C	1158 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	RRN6	YBL014C	2685 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	SHQ1	YIL104C	1524 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YBR238C	YBR238C	2196 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	MGA1	YGR249W	1371 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	LCB5	YLR260W	2064 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	RPL18A	YOL120C	561 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YOL166C	YOL166C	339 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	DDP1	YOR163W	567 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	DHR2	YKL078W	2208 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	TPD3	YAL016W	1908 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	ISW2	YOR304W	3363 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	PCL2	YDL127W	927 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	HOM2	YDR158W	1098 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	APA2	YDR530C	978 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	ECM4	YKR076W	1113 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	SDO1	YLR022C	753 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	SSO2	YMR183C	888 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	VID28	YIL017C	2766 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	VMA1	YDL185W	3216 nt		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	MIS1	YBR084W	2928 nt		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	AHP1	YLR109W	531 nt		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YSF3	YNL138W-A	258 nt		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	MDJ2	YNL328C	441 nt		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	KTR6	YPL053C	1341 nt		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	UBX5	YDR330W	1503 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	PBS2	YJL128C	2007 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	CIT1	YNR001C	1440 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YCR015C	YCR015C	954 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YDR336W	YDR336W	945 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	BMT5	YIL096C	1011 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	PSY3	YLR376C	729 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	UBP12	YJL197W	3765 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	EPO1	YMR124W	2832 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	GSC2	YGR032W	5688 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	SRO7	YPR032W	3102 nt		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	NHX1	YDR456W	1902 nt		4.15	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	BMH1	YER177W	804 nt		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	EBP2	YKL172W	1284 nt		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	RSC1	YGR056W	2787 nt		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	DSL1	YNL258C	2265 nt		4.15	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	ACA1	YER045C	1470 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	GRX3	YDR098C	858 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YGL108C	YGL108C	423 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	IRC9	YJL142C	393 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	NAT1	YDL040C	2565 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	SPT23	YKL020C	3249 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	DBP3	YGL078C	1572 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	IPI3	YNL182C	1668 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	KAR5	YMR065W	1515 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	MTD1	YKR080W	963 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	IRC25	YLR021W	540 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	MOH1	YBL049W	417 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	SIL1	YOL031C	1266 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	MRPL51	YPR100W	423 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	HPA2	YPR193C	471 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YBR096W	YBR096W	693 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	DIP2	YLR129W	2832 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	NUP85	YJR042W	2235 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	PEP7	YDR323C	1548 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	UTP25	YIL091C	2166 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	PRP9	YDL030W	1593 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	OKP1	YGR179C	1221 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YHR180W	YHR180W	492 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YLR444C	YLR444C	303 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	RUF20	RUF20	443 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	AAH1	YNL141W	1044 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	HSH49	YOR319W	642 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	USV1	YPL230W	1176 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YPR142C	YPR142C	564 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	CHD1	YER164W	4407 nt		4.12	□□□□□ -1.75

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