Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIST1H1AQ02539 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST1H1AQ02539 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST1H1AQ02539 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST1H1AQ02539 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms