Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms