Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDPQ00604 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDPQ00604 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDPQ00604 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDPQ00604 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDPQ00604 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDPQ00604 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDPQ00604 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDPQ00604 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDPQ00604 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDPQ00604 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDPQ00604 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDPQ00604 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDPQ00604 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDPQ00604 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms