Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK17Q00537 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms