Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC1P78348 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms