Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms