Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARF6P62330 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARF6P62330 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARF6P62330 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARF6P62330 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARF6P62330 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARF6P62330 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARF6P62330 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms