Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPS29P62273 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RPS29P62273 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RPS29P62273 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RPS29P62273 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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