Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSCP56915 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSCP56915 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSCP56915 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSCP56915 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSCP56915 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSCP56915 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSCP56915 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GSCP56915 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSCP56915 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSCP56915 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSCP56915 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GSCP56915 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSCP56915 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSCP56915 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSCP56915 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSCP56915 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSCP56915 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSCP56915 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSCP56915 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GSCP56915 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSCP56915 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSCP56915 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSCP56915 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSCP56915 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSCP56915 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSCP56915 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSCP56915 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms