Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR1P51861 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR1P51861 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR1P51861 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR1P51861 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR1P51861 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR1P51861 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR1P51861 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR1P51861 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR1P51861 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR1P51861 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR1P51861 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR1P51861 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR1P51861 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR1P51861 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR1P51861 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR1P51861 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR1P51861 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR1P51861 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR1P51861 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDR1P51861 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDR1P51861 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR1P51861 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR1P51861 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR1P51861 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR1P51861 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR1P51861 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR1P51861 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR1P51861 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR1P51861 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR1P51861 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR1P51861 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR1P51861 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR1P51861 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR1P51861 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR1P51861 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR1P51861 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR1P51861 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR1P51861 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR1P51861 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR1P51861 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR1P51861 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR1P51861 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR1P51861 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR1P51861 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR1P51861 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR1P51861 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR1P51861 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR1P51861 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR1P51861 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR1P51861 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR1P51861 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms