Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms