Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX5P50542 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX5P50542 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX5P50542 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX5P50542 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX5P50542 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX5P50542 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX5P50542 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX5P50542 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX5P50542 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX5P50542 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX5P50542 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX5P50542 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX5P50542 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX5P50542 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX5P50542 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX5P50542 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX5P50542 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX5P50542 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX5P50542 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX5P50542 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX5P50542 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX5P50542 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX5P50542 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX5P50542 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX5P50542 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX5P50542 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX5P50542 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX5P50542 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX5P50542 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX5P50542 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX5P50542 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX5P50542 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX5P50542 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms